使用目的不同：生物实验室是为了保护操作者和实验室外的人员不受感染。生物控制。普通洁净实验室是为了保护产品不受污染。室内环境控制。 实现方法不同：生物实验室相对大气为负压，对室内压力及相邻房间的压力梯度严格控制，控制室内气流流向。采用全新风送风，排风及送风均采用双风机系统，一用一备，自动投入运行。排风系统要加HAPE过滤器。自控要求较高。普通洁净实验室相对大气为正压且压力差值较小，对室内压力及相邻房间的压力梯度控制要求较低。一般采用新风+回风的送风系统，送风及排风系统均不用风机。排风系统不加HAPE过滤器。自控要求相对较低。 运行模式不同：生物实验室的运行模式一般有正常运行模式、值班运行模式、运行模式；根据实验室使用方式及方法的不同，对室内的条件控制及风量控制有所不同。一般洁净实验室的运行模式一般仅有正常运行模式，要求条件高的项目才会有值班运行模式，一般不会考虑运行模式。
净化实验室除了解决空气净化的问题以外，还要尽可能多的为实验工作提供方便，因此在设计上应考虑一些必备的实验室用器具。
1、互锁式传递窗：在P2实验室配有两个传递窗。保证了实验室物流的性。互锁式传递窗内有紫外线灯,当污染过物品拿出实验室前进行.互锁式传递窗还保证了室外和室内空气的隔绝,方便了实验人员的物品传递,减少了实验人员进出实验室的次数.传递窗室内室外都可控制。
2、自动闭门器：根据国家规范要求，在洁净实验室门上安装有自动闭门器。
3、互锁门：主实验室设置一套两门互锁的电子互锁,当其中有一扇门未关时,另外一扇门将无法打开这样就对进入洁净室内的气流起到缓冲作用.互锁门还配置有应急开关,当发生意外事故时,按应急开关方便实验室人员尽快逃离现场。
4、多功能微电脑控制仪：作为实验室的总控制柜，包括温湿度调节及显示、送排风机的起停和起停的顺序、照明开关、紫外灯控制等等。温度调节显示屏可准确地显示实验室内温度,调节方便,温度误差小。
洁净实验室|实验室净化工程项目的主要控管项目
l能除去空气中漂游之微尘粒子
l能防止微尘粒子之产生
l温度和湿度之控制
l压力之调节
l有害气体之排除
l结构物与隔间之气密性
l静电之防止
l电磁干扰预防
l因素之考虑
l节能之考量
食品净化生产(Produce)车间的面积与生产(Produce)相适应，布局要合理，排水畅通；GMP生产车间地面用防滑，坚固，不透水，耐腐蚀(释义:指腐烂、消失、侵蚀等)的材料修建，且平坦，无积水，并保持清洁；净化车间出口及与外界相连的排水，通风处装有防鼠，防蝇，防虫设施。
食品生产(Produce)车间内墙壁，天花板和门窗使用，浅色，防水，防霉，不脱落，易于清洗的材料修建。食用菌净化车间快速实现空间环境净化,是传统空气净化投资的20%，又能达到百级净化标准，不用任何化学、没有化学药剂残留。一年节省的药剂，即可以买一台设备，适于标准化食用菌厂和栽培户冷却室、接种室、菇房。无尘车间采用高压静电吸附除尘，静电场中的阴极线在高压静电的作用下，产生电晕放电，电晕层中产生大量的负离子，负离子在静电场的作用下，不断地向阳极运动。当空气中粉尘通过电场时，粉尘受到负离子的碰撞带上电荷，带上电荷后的粉尘同样受到静电场的作用，向阳极（集尘极）运动，到达阳极后释放电荷。食品生产(Produce)车间墙角，地角，顶角应当具有弧度(曲率半径应不小于3cm)。食品生产(Produce)车间净化车间内的操作台，传送带，运输车，工器具应当用，耐腐蚀(释义:指腐烂、消失、侵蚀等)，不生锈，易清洗，坚固的材料制作。应当在适当的地点设足够数量的洗手，，干手设备或用品，水应当为非手动开关。