大部分净水器是采用阻筛过滤原理渐进式结构方式，由多级滤芯首尾串接而成，滤芯精密度由低到高依次排列，以实现多级滤芯分摊截留污物，从而减少滤芯堵塞和人工排污、拆洗的次数以及延长更换滤芯的周期。还有一种新的设计思路是应用分质流通原理自洁式结构方式，它的设计思想不再是提供尽可能多的空间用于藏污纳垢，而是采取分质原理，分离出一小部分洁净水，同时又尽可能让原水照常流通流动起来使污质随水流及时被带走，达到流水不腐。这样既得到了净化水，又不会或不容易在机内沉淀污物，避免形成二次污染和大大减轻滤芯损耗，水质更好更又节能低炭。

由于活性碳粉的多孔结构（据估算，3~5克活性碳粉的比表面积相当于一个标准美式橄榄球场大小)，烧制之后的活性碳棒非常致密，对于自来水中的异味、气味、余氯和挥发性有机物等污染物具有很高的去除效率，部分厂家生产的活性炭棒甚至可以按照美国NSF53标准过滤孢子孢囊，并能保留水中的矿物质，无需使用微滤、超滤等额外的过滤介质。

多级过滤净水器。这种净水器有两级粗滤和一组精滤，且精滤多采用中空纤维滤芯，过滤的水可以直接饮用。多级过滤净水器属于中档净水产品，每台售价在300元至500元之间，能为工薪阶层接受，家庭使用较多。

复合烧结活性炭净水器，部分厂家生产的优质活性炭棒甚至可以按照NSF53标准过滤孢子孢囊，并有效保留水中的矿物质，无需使用微滤、超滤等额外的过滤介质。甚至某些型号的产品具备去除挥发性有机物污染物（VOC）、重金属 、有效过滤水中超过99.99%的致病，孢子包囊等微生物等指标的功能。根据性能的不同，售价在1000元至5000元不等。