殡仪馆运尸车的收费标准，除了与上文提到的殡仪车车型有关外，还与殡仪车的行程以及出车时间的早晚有关。
一般的普通金杯车，起步价为30元/10公里，如果行程超出起步价范围，按2.4元/公里进行收费。根据相关规定，殡仪馆运尸车都是按往返收费的。如果接尸时间在18:00至次日08:00之间，则被视为夜晚出车。殡仪馆夜间出车的费用是在白天出车费用基础上加收50%。
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调查显示，城市和区域之间收费标准差异不大，收费标准与当地经济发展水平呈反比。按五项费用计算，省会城市殡仪馆单具遗体平均费用为1102元，其他地级城市殡仪馆为1078元、县（市）殡仪馆为996元，大中小城市之间呈递减态势；东部省份单具遗体平均费用为1029元、中部为1073元、西部为1081元，呈东、中、西递增态势。