北京同仁医院眼底专科引领国内眼底病的发展方向，在国内率先开展了间接检眼镜下孔源性视网膜脱离的手术，开展了玻璃体视网膜显微手术，创新了视网膜中央动脉栓塞的玻璃体手术，在驱逐性出血以及眼底肿瘤的放射性敷贴和局部切除手术等多个方面处于国内和国际前沿。
在临床相关研究方面，眼底专科开展了增生性玻璃体视网膜病变发病机制的研究，视网膜下人工假体植入技术及组织相容性研究，高度近视眼致病基因定位及蛋白质组学分析，黄斑营养不良的致病基因定位研究，年龄相关性黄斑变性发病危险因素和早期干预研究，以及眼病的流行病学研究等。持续不断的获得了多项及省部级课题经费的支持。发表了系列高质量研究论文，形成了同仁品牌效应和国际影响力。北京同仁医院眼底专科坚持以临床服务为根本，以科研创新为导向，医疗、教学、科研、预防发展的目标，推动了创新型的科学研究工作的持续开展和学科临床服务水平的不断提高。
青光眼科一直以来就是同仁眼科的重点专业。多年来，在国内眼科学界长期占据优势地位，并在国际上享有一定的影响力。目前，青光眼科是中华医学会眼科学分会青光眼学组组长单位，也是中国医师协会眼科学分会青光眼委员会主任委员单位。
青光眼科主要的特点和优势是注重临床和科研相结合。在保持原有临床技术优势的情况下，注重基础科研工作，在国内学术界具有优势。
在青光眼诊断技术和方法方面，我们拥有许多先进设备：3D频域OCT、海德堡视网膜断层扫描仪(HRT)、GDx视网膜神经纤维厚度测量仪、自动视野计、多焦VEP、眼底立体照相、全景超声生物显微镜(UBM)、前节OCT、巩膜上静脉压测量仪、回弹式眼压计、超声角膜测厚仪、YAG激光机、SLT激光机等各类青光眼诊疗设备二十余台，先进程度与国际医院保持同步。可对青光眼相关各项生理指标进行客观、定量的测量。自2009年设立了24小时眼压监测室，能够对青光眼患者眼压变化做出更加准确、的评价。