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营养也是影响小儿生长发育的重要因素之一。充足和调配合理的营养是小儿生长发育的物质基础，如营养不足则首先导致小儿体重不增甚至下降，终也会影响身高的增长和身体其它各系统的功能，如免疫功能、内分泌功能、神经调节功能等。而且年龄越小，受营养的影响越大。
疾病对小儿生长发育的影响也十分明显，急性感染常使体重不增或减轻，慢性感染则同时影响体重和身高的增长。内分泌疾病(如甲状腺功能减退症)对生长发育的影响更为突出，常引起骨骼生长和神经系统发育迟缓。先天性疾病(如先天愚型)对小儿体格发育和智力发育都会产生明显影响。
性早熟是儿科内分泌系统的常见发育异常，是指女童在8岁前，男童在9岁前呈现第二性征发育的异常性疾病。中枢性性早熟（CPP）是缘于下丘脑提前增加了促性腺释放（GnRH）的分泌和释放量，提前性腺轴功能，导致性腺发育和分泌性，使内、外生殖器发育和第二性征呈现。CPP又称为GnRH依赖性性早熟，其过程呈进行性发展，直至生殖系统发育成熟。